提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

云南省政协“协商在基层”成果涌现 打通履职“最后一公里”******

　　中新网昆明1月9日电 (罗婕)政协云南省第十三届委员会第一次会议新闻发布会9日在云南昆明召开。记者从会上获悉，通过省、州(市)、县三级政协共同努力，云南省政协打造的特色履职品牌“协商在基层”启动三年来涌现出一批可借鉴、可复制、可推广的案例，推动政协协商向基层延伸，打通了履职“最后一公里”。

　　近年来，云南省政协在拓展协商形式、丰富协商内容方面取得了新突破。政协云南省第十三届委员会第一次会议副秘书长、新闻发言人张荣明介绍，“协商在基层”工作启动以来，云南省政协成功走出了一条推动政协协商向基层延伸、拓展基层群众参与政协协商渠道的创新之路，推动政协协商向基层延伸，积极把政协协商与基层社会治理有机结合，打造了集党委、政府“好帮手”、人民群众“连心桥”、委员履职“新平台”为一体的政协特色品牌。

　　张荣明表示，“协商在基层”工作通过协商主体以基层民众为主、协商议题以民生实事为主两个方面，开辟了协商为民新渠道。通过省、州(市)、县三级联动拓展了政协履职新空间，省政协成立工作推进组，州(市)政协成立工作领导小组，县级政协设立乡镇(街道)协商议事会议，让“协商在基层”成为建言资政和凝聚共识双向发力的大舞台，打通了履职“最后一公里”。

　　三年来，“协商在基层”在云岭大地涌现出一批可借鉴、可复制、可推广的案例，2021年评选出30大创新案例，2022年评选出50大典型案例，取得了实实在在的成果。

　　其中，临沧市政协从镇康县红岩村“一寨三县三乡六村”联合治理协商议事中起步，探索形成了“边寨协商”特色品牌，两次在全国政协作了大会交流，目前红岩村已创建成为中国少数民族特色村寨。而云南省政协经济委、临沧市政协、凤庆县政协三级联动开展振兴滇红茶产业协商议事，催生了凤庆滇红茶产业联盟，焕发了“滇红”品牌生机。

　　张荣明称，云南省政协十三届一次会议将于1月10日至1月14日召开，会期4天半。本次大会主要议程为，听取和审议政协云南省第十二届委员会常务委员会工作报告和关于提案工作情况的报告；列席省十四届人大一次会议，听取并讨论政府工作报告及其他有关报告；选举政协云南省第十三届委员会主席、副主席、秘书长，常务委员；审议通过省政协十三届一次会议政治决议、省政协十三届一次会议关于十二届省政协常委会工作报告等决议和报告。(完)